Le Musée jurassien des Sciences naturelles accueille plus de 35 000 planches d'herbier dont environ 80% proviennent de Suisse. Les herbiers d'illustres botanistes comme Thurmann, Bonanomi, Koby, Butignot, etc., actifs au 19^e siècle ou au début du 20^e siècle ont été déposés au MJSN. Celui-ci héberge également d'importants herbiers plus récents comme celui de J.-P. Möckli, de même que les legs d'une soixantaine de botanistes jurassiens. Ces herbiers sont les uniques témoins d'une flore suisse et jurassienne aujourd'hui en partie disparue. Par exemple, ces herbiers contiennent la Spergulaire des moissons Spergularia segetalis ou la Cotonnière de France Filago galica, deux plantes collectées en Ajoie au milieu du 19e siècle qui ont aujourd'hui disparu de Suisse.

Actuellement, ces nombreuses données sont difficilement accessibles. L'objectif du projet présenté est de mettre à disposition des scientifiques et du public les informations botaniques suisses contenues dans l'Herbier du MJSN. Pour ce faire, les informations de collecte et déterminations seront transmises :
1. au Centre du Réseau Suisse de Floristique (CRSF). Cet organisme rassemble les observations botaniques de toute la Suisse et les met à disposition de la confédération, des cantons et des scientifiques. Le public accède à ces données par le biais d'un serveur cartographique.
2. au Groupe d'étude floristique du Jura et du Jura bernois. Cette association recueille les données botaniques du Jura historique et les mets à disposition du public par l'intermédiaire d'un serveur cartographique interactif (www.filago.ch). Ce site internet permet de connaître la répartition actuelle et passée de la flore jurassienne.

Pour être intégrées dans les banques de données nationales et régionales, ces informations doivent être mises en forme. La démarche suivra les recommandations du CRSF. Sur la base des relevés de collection effectués par les conservateurs du MJSN, à chaque planche d'herbier seront assignées les informations géographiques permettant une localisation (coordonnées géographiques, communes, lieu-dit, secteur Welten & Suter, etc.). Les noms de plantes ayant passablement changé au cours du temps, une partie du travail sera consacré à déterminer les synonymes actuels.