Le Musée jurassien des sciences naturelles collabore étroitement au projet PaléoJura. Son conservateur fait partie du groupe opérationnel dont l'objectif est d'assurer le développement du projet et d'en concrétiser les différents axes, notamment par l'organisation d'activités d'animation.
Le but de cette collaboration est de coordonner des activités communes de mise en valeur afin de contribuer à la fois au développement du musée et à l'avancée du projet.

Objectifs et nature des collaborations :

1. Promotion de la paléontologie auprès du grand-public par la conception et réalisation d'expositions temporaires

2. Promotion de la paléontologie auprès des écoles par la mise sur pied d'un programme pédagogique. L'atelier "Dessine-moi un fossile" visité par des classes du canton en 2008 et en 2009 s'inscrit dans cette démarche.

3. La conservation et la valorisation des collections paléontologiques. Le MJSN est amené à gérer à terme les dizaines de milliers de fossiles mis au jour dans le cadre des fouilles de la Transjurane. Cela passe notamment par l'acquisition de locaux de stockage supplémentaires, équipés de laboratoires et de places de travail pour l'accueil des chercheurs.